Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX18Q96RF0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms