Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMG1Q96Q15 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMG1Q96Q15 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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