Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRRC7Q96NW7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRRC7Q96NW7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms