Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT3

GUCD1, Protein GUCD1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GUCD1Q96NT3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GUCD1Q96NT3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GUCD1Q96NT3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms