Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms