Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TSNARE1Q96NA8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TSNARE1Q96NA8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms