Protein–RNA interactions for Protein: Q96M98

PACRG, Parkin coregulated gene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGQ96M98 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACRGQ96M98 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms