Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00477Q96M19 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00477Q96M19 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms