Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf48Q96LL4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf48Q96LL4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms