Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALPK3Q96L96 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALPK3Q96L96 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms