Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIC2Q96JB3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIC2Q96JB3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms