Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM12Q96EX1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM12Q96EX1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms