Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFHD2Q96C19 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFHD2Q96C19 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms