Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG2BQ96BY7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms