Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRF1Q92994 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRF1Q92994 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms