Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC4Q92889 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms