Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CSRNP3Q8WYN3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms