Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG1Q8WVM7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG1Q8WVM7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms