Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WHAMMQ8TF30 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms