Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX54Q8TDD1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms