Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BRSK1Q8TDC3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms