Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE23Q8NDY6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHE23Q8NDY6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms