Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf54Q8N8G6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf54Q8N8G6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms