Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2BQ8N4Y2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2BQ8N4Y2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2BQ8N4Y2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2BQ8N4Y2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2BQ8N4Y2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2BQ8N4Y2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2BQ8N4Y2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2BQ8N4Y2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2BQ8N4Y2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2BQ8N4Y2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2BQ8N4Y2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2BQ8N4Y2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms