Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LTBP4Q8N2S1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LTBP4Q8N2S1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LTBP4Q8N2S1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms