Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK2Q8IWQ3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRSK2Q8IWQ3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms