Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX29P2Q8IUI4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms