Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HAPLN4Q86UW8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms