Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLNKQ7Z7G1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms