Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KNDC1Q76NI1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KNDC1Q76NI1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms