Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP31Q70CQ4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
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