Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN5

FOXI2, Forkhead box protein I2, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI2Q6ZQN5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXI2Q6ZQN5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXI2Q6ZQN5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms