Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CASC2Q6XLA1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms