Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RWDD4Q6NW29 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RWDD4Q6NW29 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms