Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPH2Q6IBW4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NCAPH2Q6IBW4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms