Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AGAP6Q5VW22 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AGAP6Q5VW22 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms