Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRIP1Q5VSL9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRIP1Q5VSL9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms