Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM78Q5T7P6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms