Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms