Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP188Q5SRE5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms