Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRMPD3Q5JV73 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms