Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB41Q5JT25 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB41Q5JT25 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms