Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TDRD12Q587J7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDRD12Q587J7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms