Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HS1BP3Q53T59 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS1BP3Q53T59 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms