Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACSM3Q53FZ2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms