Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4orf46Q504U0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms