Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP41Q3LFD5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP41Q3LFD5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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