Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC57Q2TAC2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC57Q2TAC2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms