Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYSND1Q2T9J0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TYSND1Q2T9J0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms