Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM71Q2Q1W2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms